种子采集品种为大红袍，选择树势强的盛果期树（10~15年生）。在8月中旬至10月上旬，果皮由绿色变为红褐色或紫黑色时采种。新采的果实放在通风处阴干，去掉果皮、杂质即得种子。种干切忌曝晒，以防种子出油。丧失发芽力。
种子收集后，若不秋冬播种，需进行贮藏，有干藏，湿藏、粪藏三种：干藏：将种于装入麻袋或瓷缸内，置通风干燥处，以备春用。湿藏：方法有三。A.将脱脂种子漂洗干净和沙混合，摊放阴凉处晾干，装入麻袋置于通风阴凉处备用（脱脂方法见播种前种子处理）。挖坑沙藏：对未脱脂种子，在背风向阳，排水良好的地方挖沟，深0.8米、宽1米， 长度随种子多少而定，隔两米竖一草把以利通气，将种子与湿沙以1:2比例拌匀贮于沟中，堆至沟沿16厘米左右，上覆纯湿沙与地面平，再覆土呈垄状，两边留排水沟，贮藏期间常翻动种子。

种子处理 1.秋播种子的处理种子处理重点是脱油处理。花椒种子空粒较多，约占50%以上，处理前先要进行水选，除去空粒，对颗粒饱满的种子进行脱油处理。先将种子放入水缸或铁锅内，用沸水烫种子4~5分钟，然后迅速加入凉水至30~40℃；二是搓油，将要处理的种子倒入2%的碱水或1%洗衣粉水浸泡2~3天，在浸泡中不断用扫帚和棍棒搅拌搓洗，脱去表层的油脂，三是清洗，浸泡过种子的水中含有大量油脂，因此要用新高脂膜800倍液冲洗干净，直至种子表面看上去黑但不发亮，然后捞出种子，堆放1~2天后，即可用于播种，播种前将种子与草木灰混合，灰的湿度以手捏成团，触之能散为宜，连灰播种。
春播的种子要进行沙藏处理沙藏时间以50天左右为宜，将种子与3倍湿沙混合（不可带泥），河沙湿度，以手握成团，手张由散为度。选排水良好的温暖地方，挖1米宽，40~50厘米深的沟，将种子放入，堆10~15厘米厚，再覆土10~15厘米，浇水渗透，上盖湿土，在土壤解冻后应及早播种。